主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探,在目击黑衣组织成员伏特加与一位社长的交易后,被另一名成员琴酒从后面袭击,并被灌下代号为APTX-4869（4869）的不明药物。后来虽然幸免于死,但身体却缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南,在邻居阿笠博士的建议下,寄住在青梅竹马毛利兰的父亲侦探毛利小五郎家中,继续秘密从事追查黑衣组织的工作,希望能够恢复到工藤新一的相貌。与此同时,柯南凭着自己的

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