留下一部分人马与御营亲卫一道保护行宫，有人打扫行宫前的战场，把尸体抬走，把鲜血用清水冲洗干净，黄得功自然不会管这些琐事，他提鞭上马，带着一支人马一阵风似地走了。
半夜三更来了这段插曲，朱由崧重到回行宫也睡不着了，眼前是四更天了，朱由崧兴致尚浓，在行宫的舞池里舞起剑来，剑光缭绕，剑风呼啸，一直到天亮。
早膳之后，朱由崧安排人立即出榜安民，身为大明龙兴之地的中都，深更半夜老打仗，老百姓人心惶惶，这一出榜诏告天下，都知道怎么回事了，原来是不法军将造反，诈降杀驾，现在皇上已经控制了局面，对这些人必将严惩不贷。
上午巳时，有人来报，黄得功带着丘钺、张杰和陈献策跪倒在宫门外请罪。
朱由崧就知道黄得功等人又没抓着李成栋，这家伙真是个泥鳅，比滑的还滑，于是传见黄得功等四人。
四将进来跪伏在朱由崧近前，满面羞愧，由黄得功禀阵经过，果然不出朱由崧所料，丘钺和张杰、陈献策连夜追杀李成栋和王直，一直追到东城门。
这时东城门处正在激战，原因是王直事先安排的人要抢占城门，守城兵将誓死力战，城门才未被抢下，李成栋和王直败到，三总兵带人马追到，自然又是场混战，结果李成栋的人马和王直的人马全部战死，但查找尸体却没有少了李成栋和王直，这时黄得功赶到了，传令全城搜查，一直搜到天亮也没有发现这二人的影子。
后来有人发现南城墙下有几具裸尸，裸尸旁边有一段由腰带和军衣做成的特殊绳子，经辨认死者全是黄得功的部下，黄得功就明白了，肯定是李成栋和王直趁乱在夜幕的掩护下跑到这里，杀了守城兵卒，用他们的衣服和腰带做成绳子从这里坠城而逃了。
黄得功气得脸都青了，抡起铁鞭咔嚓一声将南门守将的脑袋砸了个稀巴烂，但还不解气，又甩了丘钺、张杰和陈献策三个总兵每人一顿嘴巴子，三个总兵脸当时胖了，顺着嘴角流血，但是三将连个扁屁也不敢放，知道他们捡大便宜了，若非他们身为总兵，侯爷也会像砸南门守将一样用铁鞭砸烂他们的脑袋。
黄得功拿他们撒完气之后，带着三个总兵这才来向朱由崧请罪。
朱由崧仍然没有怪他们，不是黄得功等人无能，而是因为李成栋太奸猾了，但皇上越宽恕，黄得功四将心里越不安，这样一个罪大恶极之人就这便宜地成了漏网之鱼？
朱由崧笑了：“众卿，放心吧，他跑不了！”
四将自然不知其中奥妙，惊疑地看着朱由崧，朱由崧笑而不答，他自然也不敢多问。
这时有人来报，总兵官黄名因伤势过重，失血过多，不治而亡。
黄得功等人肃然，朱由崧以沉重的语气道：“黄总兵是朕的英雄，也是我大明朝的脊梁，传朕的旨意按公侯的规格厚葬之，并抚恤其妻女家小，公侯世袭。”
这时陈献策的副将来报，李成栋和王直本次投诚的部众全部抓起来了，除了八千三百人了参与昨晚的兵变，这八千三百兵将当中大部分战死，一部分被皇上直接处死，还有二千人一百人再次被俘。另外还有一万三千四百五十人未参与昨晚的兵变，经查他们对昨晚之事一无所知，对这些人特来请示如何处置。
黄得功把眼一瞪，“蠢才，请示的何来，没他娘的一个好东西，全都凌迟处死，一个不留！”
“慢！”朱由崧制止了他，“朕只杀该杀之人，不能滥杀无辜，对未参与昨晚之事的一万三千四百五十人全部释放，继续进行改编，对参与昨晚兵变的二千一百名俘虏全部斩首。”
当天一万三千四百五十名军将被无罪释放，而那参与兵变的二千一百人被砍了头，消息传出，全城轰动。市农商贾，街头巷尾，议论纷纷，无不竖大指赞成他们的陛下是一位赏罚分明、敌我分明、功过分明的英明帝王。
最感激的当然是这一万三千四百五十名兵将，他们原是高杰的旧部，被编在李成栋和王直手下听用，自此以后，感激涕零，感念皇恩浩荡，死心踏地地归顺了朝廷。
凤阳城现有五万军队，大致可分为三部分，一部分是黄得功从滁州带出的人马，一部分是朱由崧从南京带来的京营兵，还有一部分是高杰的旧部，原直属于李成栋和王直的人马，又用了三天的时间，朱由崧对这五万人马进了整编，全部成了他的死忠。
这时又一个大好的消息传来，李全带着四万人马浩浩荡荡开到了凤阳南门之外。
朱由崧喜出望外，数日之前，他亲自指挥的仪真大捷成功伏击了高杰的主力，四万人马全军覆没，算上胡茂桢的一万前军先头骑兵，准确地地说，那一战使高杰的五万大军吹灯拔蜡，光俘虏就接近三万，再算上伤兵营，超过三万一千人。
当时朱由崧急着出兵泗州，给李全留下一万人马处理仪真伏击战的战后事宜，打理战利品，清扫战场，改编俘虏，救治伤号等等，全都交给这位东厂的掌刑千户。
如今屈指一算，半个多月过去了，李全也该回来了。
朱由崧带着黄得功等人大开城门，接出南城。
皇上亲自出城迎接军将入城，那排场不是一般的大，大街小巷早就站满了执勤的甲衣兵士，一直排出城外。
此时南城外的官道上，旌旗漫天，号带飘扬，如巨龙般的队伍布满了官道，一眼望不到边。晴空秋日下，军将们甲衣闪亮，刀枪如麦穗，剑戟似麻林。
黄得功带着三个总兵官亲自护驾，加上逾千名御营卫队，没顶盔贯甲，着一身崭新的黄色团龙袍、头戴束发金龙冠的朱由崧不坐龙辇而是骑着千里一盏灯，款步前行，引得早就安定下来的城中百姓再次涌上街头竞睹龙颜。
当朱由崧的马头刚出城门洞时，百米开外的李全已经跳下战马，风尘仆仆的他一路小跑来到距离朱由崧十步左右站定，整甲抖袍，跪倒在地，往上叩头，“东厂掌刑千户李全参见皇上，吾皇万岁万岁万万岁。”